در راستای ترویج فریضۀ امربه‌معروف و نهی‌ازمنکر و تلاش برای سالم سازی محیط خانواده و جامعه و در راستای اجرای ماده ۹ و تبصره ۱ آن و ماده ۱۰ دستورالعمل اجرایی قانون حمایت از آمران به معروف و ناهیان از منکر و با هدف جلب مشارکت آحاد اقشار مرتبط با دانشگاه علوم پزشکی قم شورای عالی امر بمعروف و نهی از منکر، عفاف و حجاب، انطباق امور ادرای و فنی با شرع مقدس و صیانت از حقوق شهروندی جلسات شورای عالی امربه‌معروف و نهی‌ازمنکر در سطح دانشگاه و همچنین سطوح پایین‌تر تشکیل می‌گردد.